Os dados são o coração pulsante de qualquer operação de laboratório, quer você tenha apenas um local ou vários laboratórios espalhados pelo mundo. Mas um elemento-chave do seu sucesso é como você armazena e gerencia esses dados. Como você reúne todas essas informações pode significar a diferença entre um laboratório que funciona como um relógio ou como um pesadelo organizacional.
Para ilustrar isso, vamos dar uma olhada em uma configuração típica de armazenamento de dados e os problemas comuns que ela cria.
Três sabores de instrumentos
Se você tem muitos laboratórios ou apenas um, é provável que haja vários espaços onde as análises são realizadas. Cada processo envolverá um ou mais instrumentos, que podem ser agrupados em três tipos:
1. Instrumentos "burros"
Esses dispositivos não têm uma solução de software ou um PC dedicado. Eles normalmente se conectam diretamente a um LIMS, por meio de uma conexão serial RS-232 ou uma interface baseada em rede. Em alguns casos, uma caixa conversora é necessária para concluir uma interface de leito de rede. Balanças ou medidores de pH são exemplos comuns desse tipo.
2. Instrumentos baseados em arquivos
Um degrau acima na escada tecnológica, os instrumentos baseados em arquivos podem ser conectados a um PC que coleta os dados que eles criam. O PC também pode fazer manipulação adicional desses dados usando software fornecido pelo fornecedor. Os dados podem então ser exportados para uma unidade local ou de rede para uso posterior.
Os dados gerados por instrumentos baseados em arquivos vêm em dois formatos:
- Legível por humanos - Dados que não necessitam de nenhum software especial para que um pesquisador possa interpretá-los. Ele pode ser visualizado com aplicativos comuns encontrados na maioria dos PCs, como o Bloco de Notas do Windows.
- Não legível por humanos - Esse formato requer o software proprietário do fornecedor para visualizar e/ou manipular os dados.
3. Instrumentos "inteligentes"
Esses instrumentos modernos podem compartilhar dados por meio de várias tecnologias, incluindo streaming, vários formatos baseados em arquivos, serviços da Web ou a própria solução de integração proprietária de um fornecedor. Soluções corporativas maiores, nas quais uma solução de software pode lidar com vários instrumentos ao mesmo tempo, também se enquadram nessa categoria.
Exemplos desses tipos de instrumentos incluem sistemas de dados de cromatografia (CDS), como Empower ou Chromeleon.
Vários instrumentos & desafios de armazenamento de dados brutos
Em uma configuração de laboratório comum, os instrumentos "burros" estarão diretamente ligados ao LIMS. Os resultados desses instrumentos podem ser armazenados diretamente contra os resultados certos, mas seus dados brutos não são armazenados no data lake científico.
As outras duas categorias podem armazenar seus resultados como arquivos. Isso pode incluir:
- Um diretório de arquivos local
- Uma pasta de rede compartilhada
- Uma solução baseada em nuvem, como AWS ou armazenamento em nuvem do Azure.
O problema de gerenciar vários instrumentos dessa maneira é que os dados brutos acabam sendo armazenados em muitos locais diferentes. Isso pode criar alguns desafios:
- Manutenção de vários locais: A TI precisa manter os locais separadamente, com soluções diferentes para backup e restauração de dados.
- Duração do armazenamento: Muitos laboratórios precisam manter seus dados por 30 anos ou mais.
- Perda de dados: Os instrumentos serão substituídos ao longo do tempo, o que pode causar perda de dados. Ou PCs locais contendo dados brutos podem quebrar - outra fonte comum de perda de dados.
- Acessibilidade: Outros locais que precisam de determinados dados brutos podem não conseguir acessá-los.
O data lake científico
Um local de armazenamento central, como um data lake científico, cria um único local para todos os dados brutos, tornando obsoletos os arquivos armazenados localmente, vinculados aos próprios instrumentos. Ele se torna um local primário onde os dados podem ser recuperados de qualquer local dentro do laboratório - ou da empresa.
O data lake científico pode monitorar a pasta de armazenamento local de cada instrumento e adquirir os dados armazenados lá. Durante a aquisição, as principais informações podem ser extraídas dos dados brutos e armazenadas separadamente em um banco de dados, criando pares chave-valor que podem ser usados para procurar dados no data lake científico.
Os benefícios de um data lake científico incluem:
- Manutenção simples: A TI precisa manter apenas um local quando se trata de fazer backup e restaurar dados.
- Acessibilidade: Todos os dados brutos podem ser acessados por diferentes laboratórios em qualquer lugar da empresa.
- Minimize a perda de dados: O data lake científico se torna o local principal para todos os dados, resultando em menos perda de dados.
- Evite a duplicação de testes: disponibilizar os dados para todos em sua operação limita a duplicação de análises.
Mais do que apenas armazenamento
Um data lake científico pode oferecer enormes benefícios simplesmente simplificando o armazenamento de dados. No entanto, uma etapa adicional pode torná-lo ainda mais eficiente. Por que não conectar dados brutos dentro do sistema LIMS diretamente às amostras criadas?
Veja como isso funciona:
- Os dados brutos gerados durante as análises conterão IDs de amostra, IDs de instrumento e outros identificadores exclusivos de objetos atualmente no LIMS.
- Sempre que os dados são gerados e armazenados no data lake científico, os pares de chave-valor podem ser usados para garantir que os dados brutos estejam diretamente conectados aos registros no sistema LIMS. Assim, sempre que uma amostra é visualizada no LIMS, os dados brutos correspondentes (disponíveis no data lake) podem ser acessados a partir desse registro.
- Todos os dados brutos gerados dentro do laboratório não são mais armazenados em um grande banco de dados (ou seja, o data lake científico). Em vez disso, o LIMS cria uma hierarquia vinculando todos os dados aos registros corretos. Exemplos disso podem incluir o seguinte:
- Mostrar todos os dados brutos associados a uma determinada amostra
- Mostrar todos os dados brutos adquiridos por um determinado instrumento
- Um estudo de estabilidade completo pode ser resumido, mostrando todos os seus dados brutos em uma saída do LIMS
- E muitas outras possibilidades...
A vantagem do LIMS da LabVantage
O LIMS da LabVantage pode fornecer um sistema de gerenciamento de dados científicos (SDMS) totalmente integrado, criando um local de armazenamento central conveniente. O SDMS monitorará os locais para os quais os instrumentos enviam seus dados, interpretando e armazenando os dados que fornecem.
As seguintes opções de armazenamento estão disponíveis:
- Local do arquivo de rede
- Armazenamento de banco de dados
- Armazenamento em nuvem, como AWS e Azure
Todos esses locais são acessíveis apenas através do LIMS, garantindo que o link entre os dados e as capturas no LIMS não se quebrem. Se for necessária uma análise adicional, os dados podem ser baixados do LIMS novamente.
Como o LIMS é um local central para os dados, ele automaticamente torna o SDMS o local central para dados brutos.
Para obter mais detalhes sobre esse processo e sobre como um SDMS pode transformar sua operação de laboratório, fale conosco hoje mesmo.
