Todo o propósito, ou pelo menos um propósito principal - de um LIMS é a capacidade de confiar nele como um repositório central para "todas as coisas do laboratório". No entanto, a capacidade do LIMS de servir como centro de informática de um laboratório é tão boa quanto sua capacidade de falar com outros instrumentos e sistemas.
Existem muitos tipos diferentes de instrumentos que um gerente de laboratório pode querer conectar ao LIMS, e estes são categorizados como "instrumentos simples" ou "instrumentos complexos".
Instrumentos simples versus complexos
Qual a diferença?
Um instrumento "simples" é definido como aquele que utiliza um protocolo como o RS-232. Estes:
- Gerar resultados brutos de teste sem conhecer IDs de exemplo
- Receber comandos de forma síncrona
- Opcionalmente, envia respostas de volta.
Exemplos de tais instrumentos incluem balanças de peso ou medidores de pH.
Conectar-se com instrumentos simples deve ser... como dizer... simples.
O LabVantage tem uma solução completa pronta para uso para conectar instrumentos simples, uma funcionalidade que não requer licenças especiais ou software.
Instrumentos complexos, por outro lado, normalmente retornam vários resultados, potencialmente para várias amostras. Eles também podem ser interfaceados bidirecionalmente para receber listas de trabalho. A comunicação com instrumentos complexos pode ocorrer através de arquivos ou através de uma interface de rede (TCP/IP). Exemplos incluem sistemas de cromatografia, juntamente com as soluções de software que acionam esses instrumentos (por exemplo, Thermo Chromeleon ou Agilent OpenLab).
LabVantage SDMS
O LabVantage facilita a integração de ferramentas complexas de laboratório através do nosso SDMS. O módulo oferece fortes recursos de leitura/gravação/envio/recebimento e transformação de dados para aproveitar o poder da instrumentação do seu laboratório.
Os drivers SDMS são baseados no poderoso programa Talend Open Studio ETL. Faz interface com instrumentos complexos via arquivos ou TCP/IP para enviar e receber dados de e para o LIMS. O módulo usa ETL - Extract, Transform, and Load - uma inicialidade padrão da indústria para software usado para lidar com dados que podem ser complexos e volumosos.
Embora os resultados do instrumento não sejam normalmente considerados Big Data, o software ETL tem o poder e a taxa de transferência necessários para lidar com o que poderia ser potencialmente grandes conjuntos de dados do instrumento.
Uma vez que o módulo é ativado, o SDMS é parte integrante da plataforma LabVantage e aparece dentro da aplicação como páginas web normais para configuração e gerenciamento de dados. Além disso, coletores SDMS adicionais - uma funcionalidade que coleta os dados de fontes de laboratório - podem ser instalados em outros servidores ou computadores que executam software de instrumento de laboratório.
Certifique-se de que sua trilha de auditoria seja forte
Para instrumentos e software que gravam arquivos, um coletor SDMS pode acessar sistemas de arquivos remotos para ler e gravar arquivos e logs de instrumentos.
Muitos gerentes de laboratório têm preocupações sobre a questão agora essencial de trilhas de auditoria, notificações e logs. O LabVantage SDMS aborda isso de várias maneiras para garantir que seu laboratório siga os mais altos padrões de integridade de dados.
Como funciona:
- Quando o SDMS da LabVantage recebe dados diretamente pela rede ou detecta que um novo arquivo de instrumento foi gravado, ele rapidamente pega o arquivo, analisa os dados e importa esses resultados diretamente para o LabVantage com uma trilha de auditoria completa.
- Depois de postar com êxito os resultados no LIMS, o SDMS empacota, criptografa e coloca automaticamente todos os arquivos de dados originais em um repositório de anexos, que conclui a trilha de auditoria para os dados inseridos e originais antes da análise.
- Se uma transação falhar, os usuários serão notificados para que o reprocessamento dos dados originais possa ser executado.
- O SDMS retém os dados originais e os arquivos de log de transações bem-sucedidas e com falha no repositório de anexos para que os laboratórios possam mantê-los para auditoria e rastreabilidade futuras.
LIMS D.I.Y. Drivers de instrumentos para interface de instrumentos
Nossa conferência anual CTEC é uma grande fonte de aprendizado não apenas para nossos clientes, mas também para nós. Algumas das atualizações e mudanças de plataforma que fazemos no LIMS da LabVantage ocorrem diretamente através de nossa interação com os usuários.
Um desses recursos são os drivers de instrumentos de autoatendimento. Em vez de o LabVantage escrever código para instalações de clientes para analisar dados complexos de instrumentos, os clientes há muito pedem a capacidade de criar e modificar seus próprios drivers. O SDMS permite que os clientes façam o autoatendimento até mesmo de drivers complexos!
Como o Talend Open Studio é uma ferramenta de ETL de código aberto, qualquer pessoa com conhecimento da ferramenta pode criar drivers SDMS. E com mais de 200 componentes de arrastar e soltar para receber, transformar e carregar dados, o Open Studio é o ambiente ideal para analisar e postar dados de instrumentos.
Criar e implantar drivers de instrumentos em um LIMS executa a gama de dificuldades. Alguns são mais fáceis de desenvolver, enquanto outros não.
Os drivers podem ser tão simples quanto ler, mapear e postar dados. Por outro lado, eles podem envolver manipulação pesada de dados e execução de consultas no LIMS para coletar informação suplementar antes de postar os dados.
Dados complexos de instrumentos são difíceis de normalizar e transformar para uso no LIMS. Embora isso fosse mais verdadeiro historicamente do que é hoje, tais integrações ainda podem ser complicadas. O uso da interface gráfica do Open Studio ajuda muito a simplificar essa tarefa.
Interfaces de instrumentos perfeitas
Enquanto os desenvolvedores e as equipes de TI querem a flexibilidade para desenvolver até mesmo os drivers mais complexos, a maioria dos usuários quer apenas uma experiência perfeita. O SDMS foi projetado com usabilidade e acessibilidade em mente, em particular para instrumentos bidirecionais.
Uma vez que um driver tenha sido desenvolvido, ele pode ser rapidamente exportado e carregado no LIMS da LabVantage para ser usado pelo SDMS. O fluxo de trabalho do driver é simples:
- O usuário envia a lista de trabalho para o instrumento.
- O software do instrumento carrega a lista de trabalho e a executa.
- Os dados são então retornados diretamente para o LIMS da LabVantage .
Se você gostaria de criar seus próprios drivers de instrumentos LIMS ou fazer com que os serviços profissionais da LabVantage os criassem para você, o SDMS tem o poder de conectar qualquer instrumento ou software ao seu sistema LabVantage.
